הרב יוסף קלנר הינו הוגה דעות בענייני אמונה ומחשבה מרבני הציונות הדתית, תלמיד של הרב צבי-יהודה (הרצי"ה), ובקי בכתבי הרב קוק זצ"ל כמו גם בספרי אמונה רבים אחרים. דרכו של הרב בלימוד מושגי אמונה הינה עמקנית, ועולמות התוכן המשולבים בשיעורים לעיתים שואבים ממקורות פילוסופיים ומדעיים מיריעה רחבה של מקורות וכתבים.

מכתביו של הרב: "הקריטריון לאמת, הקריטריון למוסר", "כארי יתנשא", "חסד למשיחו", "הוד הקרח הנורא", עריכת מילון הראי"ה, "שיר התקדש חג" (סדרה לביאור הארת הזמנים על חגים ומועדים שונים), "איתי מלבנון כלה", "הרב ובנו", פירוש על ספר הכוזרי (טרם הסתיים), ומאמרים וכתבים רבים אחרים.

הרב לימד ומלמד במסגרות שונות במשך שנים רבות, ביניהן - מוסדות בני-דוד בעלי, נתיבות אמונה, מכון מאיר, עטרת ירושלים, ומעלה אליהו.